Bagian kedua dari Anime Spy x Family yang sebelumnya menceritakan misi operation strix, Tasogare atau agen Twilight menyamar sebagai psikiater dengan nama baru Loid Forger. Demi misi, Loid mengadopsi Anya yang ternyata seorang yang dapat membaca pikiran orang lain. Tak hanya itu, istri barunya, Yor yang ia temui di butik ternyata seorang pembunuh bayaran (assassin). Demi kepentingan masing-masing, ketiganya berakting menjadi keluarga yang baik untuk menutupi identitas asli mereka. Dengan berbagai usaha, akhirnya Anya dapat masuk sekolah elit satu kelas dengan Damian Desmond, anak dari Donovan Desmond yang merupakan target operation strix. Namun, ini baru awal misi yang diemban keluarga Forger.
